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篇1:我国家禽遗传多样性研究前景诱人
我国家禽遗传多样性研究前景诱人
在1992年的里约热内卢,中国作为首批签约的'国家在世界生物多样性公约上签字.从此,中国生物遗传多样性保护工作具有了国际化的使命.
作 者:陈宽维 作者单位:中国农业科学院家禽研究所,扬州,225003 刊 名:中国家禽 PKU英文刊名:CHINA POULTRY 年,卷(期):2003 25(2) 分类号:F307 关键词:篇2:大别山山核桃种群遗传多样性研究
大别山山核桃种群遗传多样性研究
为了更有效地保护和合理开发大别山山核桃(Carya dabieshanensis)资源,该文利用RAPD分子标记技术,对3个天然大别山山核桃种群的90个单株的遗传多样性、种群内和种群间的遗传变异进行了研究,结果表明:20对10bp随机引物共检测到238条谱带,其中多态带为162条,占68.1%.遗传多样性分析结果显示:Shannon多样性指数为0.476 1,58.18%的变异分布于群体内,而种群间变异占了41.82%;Nei指数群体总基因多样度为0.314 5,群体内平均基因多样度(HS)为0.186 5,群体间的'基因多样度(HST)为0.128 0,群体Nei基因分化系数(GST)为0.406 7,说明40.67%的变异存在于种群间,群体内的变异占了总变异的59.33%,与Shannon多样性指数相比基本一致,均表明种群内有较丰富的遗传变异,这为优良品种选育提供广阔前景;种群间的基因流(Nm)为0.730 6,证明种群间遗传交换较小,这与环境适应性和高山阻隔有一定的关系.
作 者:王正加 黄有军 郭传友 黄坚钦 王华芳 WANG Zheng-Jia HUANG You-Jun GUO Chuan-You HUANG Jian-Qin WANG Hua-Fang 作者单位:王正加,WANG Zheng-Jia(北京林业大学生物科学与技术学院,北京,100083;浙江林学院现代森林培育省级重点实验室,浙江,临安,311300)黄有军,黄坚钦,HUANG You-Jun,HUANG Jian-Qin(浙江林学院现代森林培育省级重点实验室,浙江,临安,311300)
郭传友,GUO Chuan-You(淮北煤碳师范学院生物系,安徽,淮北,235000)
王华芳,WANG Hua-Fang(北京林业大学生物科学与技术学院,北京,100083)
刊 名:植物生态学报 ISTIC PKU英文刊名:JOURNAL OF PLANT ECOLOGY 年,卷(期):2006 30(3) 分类号:Q948 关键词:山核桃 种群 RAPD分析 遗传多样性篇3:我国生物柴油产业化前景诱人
我国生物柴油产业化前景诱人
应对能源危机是本世纪人类面临的'巨大挑战.据国际机构最新估算,世界上石油稳定供给不会超过,枯竭期仅为50年.中国是世界上石油资源相对贫乏的国家,因此对生物能源及新材料的研究尤为重要.
作 者:柯路 作者单位: 刊 名:技术与市场 英文刊名:TECHNOLOGY AND MARKET 年,卷(期):2009 16(4) 分类号: 关键词:篇4:中国绿豆种质资源遗传多样性研究
中国绿豆种质资源遗传多样性研究
分析中国作物种质资源数据库中5072份国内绿豆资源的地理分布,并对14个性状(6个质量性状和8个数量性状)进行遗传多样性分析.结果表明:我国绿豆种质资源分布在约28个纬度、60个经度内,其中29~41°N×107~123°E范围内分布最多,占总材料数的.75.99%.6个质量性状中荚色的遗传多样性指数最高,而8个数量性状中百粒重的遗传多样性指数最高.35~37°N×111~115°E、37~39°N×111~115°E、39~41°N×115~119°E、41~43°N ×115~119°E几个小区遗传多样性指数较高,可初步推断中国绿豆资源遗传多样性中心在35~43°N×111~119°E范围内.
作 者:刘长友 程须珍 王素华 王丽侠 孙蕾 梅丽 徐宁 LIU Chang-you CHENG Xu-zhen WANG Su-hua WANG Li-xia SUN Lei MEI Li XU Ning 作者单位:中国农业科学院作物科学研究所,北京,100081 刊 名:植物遗传资源学报 ISTIC PKU英文刊名:JOURNAL OF PLANT GENETIC RESOURCES 年,卷(期):2006 7(4) 分类号:Q94 关键词:绿豆 种质资源 遗传多样性篇5:莲科系统学和遗传多样性研究现状
莲科系统学和遗传多样性研究现状
分析回顾了莲科的系统位置、莲品种分类的现状与问题和莲的遗传多样性.莲科(Nelumbonaceae)植物传统上被归入睡莲科(Nymphaeaceae).许多研究表明,莲科与睡莲科在形态、细胞、孢粉等方面差异很大,因而建立莲科,置于睡莲目(Nymphaeales)、毛茛目(Ranunculales)或莲目(Nelumbonales)中.分子系统学研究发现,睡莲科为被子植物的基部类群之一,而莲科则是真双子叶植物的基部类群之一,与山龙眼科和悬铃木科有密切关系.莲科含莲(Nelumbo nucifera)和美洲黄莲(N.lutea)两种,间断分布于太平洋的两岸.莲在我国有悠久的栽培历史和广大的栽培面积,栽培品种超过600个.由于杂交和反复回交的原因,品种之间的遗传关系非常复杂.莲的'遗传资源的研究还很不充分,尤其是野生类型.对一些栽培品种的研究其实验材料又含有美洲黄莲的遗传组分,因而多高估了莲的遗传多样性.
作 者:田红丽 周世良 TIAN Hong-Li ZHOU Shi-Liang 作者单位:田红丽,TIAN Hong-Li(中国科学院植物研究所系统与进化植物学国家重点实验室,北京,100093;中国科学院研究生院,北京,100039)周世良,ZHOU Shi-Liang(中国科学院植物研究所系统与进化植物学国家重点实验室,北京,100093)
刊 名:云南植物研究 ISTIC PKU英文刊名:ACTA BOTANICA YUNNANICA 年,卷(期):2006 28(4) 分类号:Q949 Q948 关键词:莲科 莲属 品种 遗传多样性 系统学篇6:黄淮山羊与长江三角洲白山羊遗传多样性研究
黄淮山羊与长江三角洲白山羊遗传多样性研究
采用中心产区典型群随机抽样方法和多种电泳技术检测53只黄淮山羊、30只长江三角洲白山羊编码血液蛋白17个结构基因座上的变异,分析其遗传多样性.结果表明:黄淮山羊、长江三角洲白山羊结构基因座平均杂合度分别为0.082 6和0.089 9;平均多态信息含量分别为0.069 9和0.089 9;平均有效等位基因数分别为1.0000和1.153 3.黄淮山羊与长江三角洲白山羊群体对于“东亚集团”的基因贴近度分别为0.8445、0.898 1,对于“南亚集团”的基因贴近度分别为0.744 0、0.8201,说明黄淮山羊群体与长江三角洲白山羊群体应属于“东亚山羊集团”.该研究结果符合山羊播迁的路线并与其地理分布相吻合.
作 者:王庆华 常洪 杨章平郭小雅 任湘莲 作者单位:王庆华(南通大学实验动物中心,江苏,南通,226007)常洪,杨章平,郭小雅,任湘莲(扬州大学动物科学与技术学院,江苏,扬州,225009)
刊 名:安徽农业科学 ISTIC PKU英文刊名:JOURNAL OF ANHUI AGRICULTURAL SCIENCES 年,卷(期):2006 34(16) 分类号:Q346 关键词:黄淮山羊 长江三角洲白山羊 结构基因座 遗传多样性篇7:南海斑点马鲛群体遗传多样性研究
南海斑点马鲛群体遗传多样性研究
摘要:本研究采用PCR技术对采自广州附近海域的斑点马鲛,19个个体的线粒体DNAD-loop基因进行扩增和分析,结果表明,该斑点马鲛群体的遗传多样性较为丰富,19个个体通过聚类形成2大分支,表明该群体可能来源于2个不同的母系祖先。
关键词:遗传多样性; 斑点马鲛; 线粒体DNA
斑点马鲛属鲭科马鲛属,是暖水性鱼类,是我国南海区重要的经济鱼类。目前尚无关于斑点马鲛群体遗传多样性的研究报道。线粒体DNA控制区是整个mtDNA序列和长度变异最大的区域,被广泛应用于鱼类种群遗传学研究。本研究利用相应的引物对分布于南海的斑点马鲛的控制区部分序列进行了PCR 扩增和序列测定,分析该斑点马鲛群体的遗传多样性,以期为制定合理的斑点马鲛资源增殖和保护措施提供科学依据。
1 材料和方法
1.1实验材料 斑点马鲛样品于6月取自广州,冷冻或新鲜样品运回实验室,取背部肌肉保存于95.0%酒精中。
1.2 实验方法 按传统法(酚/氯仿抽提法)从肌肉中提取基因组DNA,将提取DNA溶解于超纯水中,置4ºC保存。用于扩增控制区的扩增引物为:DL-:5’-CTGGAAAGAACGCCCGGCATG-3’。PCR反应体积为25 µL,其中包括50 mmol/L KCl,10 mmol/L Tris-HCl,pH8.3,MgCl2 1.5 mmol/L,dNTP 200 µmol/L,Ex Taq酶1.25 units,引物0.2 mmol/L,模板DNA 1µL,加灭菌蒸馏水至25 µL。PCR反应在Eppendorf Mastercycler 5333扩增仪上进行。PCR反应条件为:94℃预变性3 min,然后进行40个循环,每个循环包括94℃45s,50℃45s,72℃ 1 min,最后72℃延伸10 min。以上反应均用阴性对照来检查是否有DNA污染。取1.5 µL扩增产物用1.5%琼脂糖凝胶电泳检测。用小量胶回收试剂盒(上海华舜生物工程有限公司)进行PCR产物回收和纯化,回收产物由上海桑尼生物科技有限公司经ABI公司3730 型全自动序列分析仪进行测序。
1.3 数据分析 用DNASTAR软件进行排序,并结合人工校正。通过MEGA(molecular evolutionary genetics analysis, Kumar 等,1993)软件统计所测序列的碱基组成,并计算出不同个体间的遗传距离,并构建NJ系统树。用DNASP(DNA Sequences Polymorphism)软件进行单倍型多样度(HD)、核苷酸多样性(Pi)、平均核苷酸差异数(K)等遗传多样性参数的计算。
2 结果
2.1 目的片段的PCR扩增及序列测定 本实验共测定了斑点马鲛的19个个体的mtDNA D-loop基因片段,其碱基序列为514bp,A、T、C、G 4种碱基在19个个体中的平均含量分别为35.5%(35.2%-35.8%)、30.6%(30.1%-30.9%)、19.4%(19.1%-19.7%)、14.5%(14.2%-15.0%),AT含量(66.1%)高于GC含量(33.9%),其碱基的平均含量与蓝点马鲛比较相似。斑点马鲛mtDNA-loop基因的AT含量(66.1%)与蓝点马鲛(68.2%)、太平洋鲭鱼D-loop基因的AT含量(63.8%)非常接近,这也符合脊椎动物mtDNA D-loop区域碱基组成的特点。
2.2 变异位点的分布 31个变异位点在19条斑点马鲛D-1oop序列中的分布如表1所示,其中简约信息位点为8个,它们分别位于第18、24、80、196、217、277、384、442位,其余的23个为单态信息位点。从表中还可以看出,19个个体的序列除2号和8号鱼序列相同外,其他个体都不完全相同,即19个个体共有18种单倍型,单倍型多样度为0.994,核苷酸多样度为0.00798。514 bp长度的核苷酸序列中共存在3个碱基插入(24、180、494),20个转换位点(A-G、C-T),5个颠换位点(位点8、34、282、488、491)及3个转换与颠换同时存在的位点(位点197、198、483)。
2.3 斑点马鲛不同个体间的遗传距离 应用MEGA2软件,根据D-loop序列算出了19个个体间的Kimura遗传距离,19个个体中,除了SG2和SG8之间的遗传距离为0.0000,其他任何2个个体间的遗传距离均不为0.000,故共有18种单倍型;19个个体中SG.12与SG.14的遗传距离遗传距离最大为0.0179;19个个体间的碱基差异数在0~9之间。
2.3 NJ系统树的构建 以19个个体的控制区序列构建的NJ系统树分别如图1所示。从图中可以看出,2种方法得到的系统树的拓扑结构相似,19个个体形成了2大分支。线粒体DNA属于母系遗传,可推断该群体的19个个体可能来源于2个不同的母系祖先。
3 讨论
在19个蓝点马鲛个体中检测到18个单倍型,单倍型多样度为0.994,核苷酸多样度为0.00798。本研究从控制区序列获得的群体遗传多样性参数和个体间的.遗传距离都表明了,斑点马鲛南海水域群体目前的遗传多样性非常丰富。这种现象一方面与种类差异有关;另一方面,可能与斑点马鲛的栖息地多样性、活动范围大有关。因为斑点马鲛有广泛分布于南海水域的产卵场、索饵场和越冬场,并作长距离洄游。此外,斑点马鲛不同于梭鱼等其它增养殖鱼类,尚未受到由于种苗培养而导致的近交等方面的影响,因而具有较丰富的遗传多样性。从遗传学角度讲,一个物种的遗传多样性高低与其适应能力、生存能力和进化潜力密切相关。物种的遗传多样性越丰富,其进化的潜力就越大,或者说遗传多样性为物种的进化提供了潜在的原料储备。而遗传多样性的降低可导致其适应能力降低、物种退化甚至威胁物种生存。近年来由于盲目发展流网数量,网目缩小以及秋后大量拖捕当年幼鱼,致使鱼体小型化、渔获组成低龄化,严重损害幼鱼资源,造成产量不稳。长久下去,将会损害其遗传多样性和种质资源的稳定性。因此,应采取有效措施,以维持现有的遗传多样性为前提,合理保护斑点马鲛种质资源,以求其资源的可持续利用。
篇8:4种经济鲍遗传多样性与分化的研究
4种经济鲍遗传多样性与分化的研究
应用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术研究盘鲍(Haliotis discus discus)、皱纹盘鲍(H.discus hannai)、九孔鲍(H.diversicolor supertexta)养殖群体和杂色鲍(H.diversicolor diversicolor)自然群体遗传多样性与分化结果表明,4种经济鲍的遗传多样性较低,盘鲍群体平均每位点等位基因数目、多态位点百分数(P0.99%)、观察杂合度和期望杂合度分别为1.2、16.67、0.109和0.061,皱纹盘鲍群体分别为1.10、11.11、0.093和0.056,杂色鲍群体分别为1.44、33.33、0.106和0.118,九孔鲍群体分别为1.50、33.33、0.135和0.128.盘鲍在Mdh- 1位点上符合H-W平衡标准(P>0.05),而在位点Est- 3(F=-0.753)和Sod- 1-1(F=-1.000)上表现出杂合子过量;皱纹盘鲍在位点Est- 3符合H-W平衡标准(P>0.05),而在位点Est- 3(F=-0.371)和Sod-1(F=-1.000)上表现出杂合子过量;杂色鲍在位点Est- 3、Mdh- 1和Amy- 1上符合H-W平衡标准(P>0.05),而在位点Aat- 1(F=-0.486)和Mdh- 1(F=-0.210)上表现出杂合子过量,在位点Est-2(F=0.597)、Amy-1(F=0.330)和Me-1(F=1.000)上表现出杂合子缺失,九孔鲍在位点Est-3、Sdh-2、Amy-1和Mdh-1上符合H-W平衡标准(P>0.05),而在位点Aat- 1(F=-0.477)和Amy- 1(F=-0.149)上表现出杂合子过量,在位点Est-2(F=0.540)上表现出杂合子缺失.盘鲍和皱纹盘鲍的遗传距离为0.055,九孔鲍和杂色鲍的.遗传距离为0.016.
作 者:黎中宝 刘文彪 韩芳 李华 陈孝德 LI Zhong-Bao LIU Wen-Biao HAN Fang LI Hua CHEN Xiao-De 作者单位:集美大学水产学院,厦门,361021 刊 名:中国生态农业学报 ISTIC PKU英文刊名:CHINESE JOURNAL OF ECO-AGRICULTURE 年,卷(期):2005 13(4) 分类号:X17 关键词:盘鲍 皱纹盘鲍 杂色鲍 九孔鲍 等位酶 遗传多样性 遗传分化 杂合子缺失篇9:卷丹种内居群的遗传多样性研究
卷丹种内居群的遗传多样性研究
从形态学和细胞学2个方面对卷丹4个居群进行了调查研究,结果表明:吉林居群BH19和辽宁居群BH34的欧式距离最小,黑龙江居群BH126和吉林居群BH19的欧式距离最大;黑龙江居群BH126的'核型公式为2n=36=3m+3sm(3SAT)+12st+18t,吉林居群BH19的核型公式为2n=36=6m (6SAT)+12st+18t,辽宁居群BH34的核型公式为2n=36=6m (6SAT)+15st+15t,湖北居群BH82核型公式为2n=36=6m (6SAT)+12st+18t;居群间变异稳定,与形态学分析一致.
作 者:岳玲 雷家军 作者单位:沈阳农业大学园艺学院,辽宁沈阳,110161 刊 名:安徽农业科学 ISTIC PKU英文刊名:JOURNAL OF ANHUI AGRICULTURAL SCIENCES 年,卷(期):2006 34(22) 分类号:Q94 关键词:卷丹 居群 遗传多样性篇10:山西马身猪mtDNA D-loop遗传多样性研究
山西马身猪mtDNA D-loop遗传多样性研究
马身猪为山西省著名的优良地方猪种.本研究采用PCK-SSCP和克隆测序技术相结合的方法,对马身猪39个个体的'线粒体DNAD-loop进行了遗传多样性分析.结果发现,39个个体间未见单链构象多态,后抽测的 2个D-loop全序列除串联重复序列外,也未见序列多态.试验表明,山西马身猪群体mtDNA多态性较为贫乏.
作 者:黄静 武建亮 乔利英 刘建华 刘文忠 作者单位:山西农业大学动物科技学院 刊 名:农业技术与装备 英文刊名:AGRICULTURAL TECHNOLOGY & EQUIPMENT 年,卷(期):2009 “”(11) 分类号:S432 关键词:马身猪 线粒体DNA D-loop 遗传多样性★ 乡村看家禽作文
我国家禽遗传多样性研究前景诱人(精选10篇)
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